Doktorand i Evolutionär ekologi och genomik

Publiceringsdatum: 2026-04-08

Ett spännande jobb som doktorand hos Uppsala Universitet väntar på dig - varför inte söka idag? Intresserade sökes för heltid-jobb hos Uppsala Universitet - är du intresserad? De letar efter någon som vill jobba 6 månader eller längre. Platsen där jobbet finns ledigt är i Uppsala.

Uppsala Universitet söker för närvarande efter ambitiösa individer som vill utvecklas i rollen som doktorand. Kolla in deras ledig tjänst och se om du har vad som krävs för att bli en del av deras team. Uppsala Universitet letar efter erfaren doktorand som kan ansluta till deras team. Sista ansökningsdag är fredag den åttonde maj 2026.

Jobbannons

Doktorand i evolutionär ekologi och genomik med inriktning mot amfibiers hudmikrobiom

Institutionen för ekologi och genetik vid Uppsala universitet är en del av Evolutionsbiologiskt centrum (EBC). Vi utlyser nu en doktorandanställning i evolutionär ekologi och genomik, med fokus på biodiversitet och evolution av amfibiers hudmikrobiom, inom forskningsprogrammet Zooekologi. Läs mer om vår forskning på www.ieg.uu.se.

Projektbeskrivning

Mikroorganismers påverkan på värdars ekologi och evolution är en grundläggande biologisk fråga. Mikrobiomet kan ha en stark inverkan på värdens beteende, hälsa och immunförsvar, och förändrade temperaturer kan påverka relationerna mellan värd och mikrobiom i vilda populationer. Storskaliga studier visar att hudmikrobiomet hos groddjur förändras längs latitudinella gradienter och störs av temperatur och infektioner, men storskalig forskning om mikrobiom-värd-interaktioner hos vilda groddjur är fortfarande begränsad.

Doktoranden ingår i projektet ”Groddjurs hudmikrobiom och infektionssjukdomar” i Maria Cortazar Chinarros forskargrupp. Anställningen är finansierad i fyra år. Mer information om forskningen finns här: https://www.uu.se/institution/ekologi-och-genetik/forskning/zooekologi/cortazar-chinarros-grupp

Projektet undersöker hudmikrobiomens mångfald och sammansättning hos populationer längs regionala till storskaliga latitudinella gradienter. Metagenomiska resurser av hög kvalitet genereras från huden hos vanliga och hotade groddjursarter för att kunna dra slutsatser om fylogenetiska relationer och undersöka hur värdens evolutionära historia, genetiska variation, miljöfaktorer (abiotiska faktorer) och infektionssjukdomar formar interaktionerna mellan värd och hudmikrobiom. Projektet kommer att karakterisera hudmikrobiomet – inklusive bakterier, virus, svampar och protister – med hjälp av ett integrerat angreppssätt som kombinerar metabarkodning, metagenomik och populationsgenomik.

Doktoranden kommer att tillämpa ett brett spektrum av bioinformatiska metoder och sekvenseringstekniker, inklusive amplikonsekvensering, shotgun-metagenomik och metatranskriptomik. Arbetet omfattar även fältarbete och molekylärlaborativt arbete för att generera sekvenseringsdata av hög kvalitet.

Arbetsuppgifter

I början av doktorandutbildningen kommer den utvalda kandidaten att organisera, samordna och genomföra regionalt och storskaligt fältarbete, samt molekylärlaborativt arbete, inklusive extraktion av DNA och RNA och preparering av prover för sekvensering (amplicon- och metagenomiska bibliotek). Beroende på datakvalitet, tillgången till patogenresurser och doktorandens intressen kan projektet senare komma att utvidgas till att undersöka nya och framväxande sjukdomar samt utveckla verktyg för att upptäcka dessa hos vilda groddjur.

Doktorander vid Institutionen för ekologi och genetik uppmuntras att delta i undervisning, vanligtvis upp till 20 % av heltid, främst som undervisningsassistenter i grundutbildningskurser i biologi.

Kvalifikationskrav

För att uppfylla behörighetskraven för forskarutbildning måste du:

• ha en masterexamen (avancerad nivå) i ekologi, evolutionsbiologi, naturvårdsbiologi eller ett närliggande område, eller
• ha fullgjort minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 hp på avancerad nivå inklusive ett självständigt arbete om minst 15 hp, eller
• på annat sätt ha förvärvat motsvarande kunskaper.

Den sökande ska ha en masterexamen i evolutionär ekologi eller ett närliggande område, med stark bakgrund inom värd–parasit-evolution och genomik. Erfarenhet av bioinformatiska analyser, inklusive populationsgenomik och metagenomik, är ett krav, liksom dokumenterad erfarenhet av molekylärbiologiska laboratoriemetoder och arbete med högkapacitetssekvensering. B-körkort är obligatoriskt då tjänsten innefattar fältarbete.

Meriterande

Erfarenhet av mikrobiomanalyser och ekologiskt fältarbete är meriterande. Vi värdesätter god samarbetsförmåga, kommunikation samt personliga egenskaper såsom nyfikenhet, initiativförmåga, ansvarstagande och förmåga att arbeta både självständigt och i grupp. Erfarenhet, såsom experimentell evolution med infektionssjukdomar, ses som meriterande.

Anställningsvillkor

Anställningen är en tidsbegränsad doktorandanställning enligt Högskoleförordningen 5 kap. 7 §. Omfattning: heltid. Startdatum: 2026-10-01 eller enligt överenskommelse. Placering: Uppsala.

Kontaktperson: Forskargruppsledare Maria Cortazar Chinarro E-post: maria.cortazar@ebc.uu.se

Ansökningsinstruktioner

Ansökan ska innehålla 1) Ett personligt brev där du beskriver dig själv, dina forskningsintressen, varför du vill doktorera och varför du är lämplig för tjänsten (max 2 sidor), 2) CV, 3) Kort beskrivning av din utbildning, 4) Kopia av masterexamen och kursbetyg samt kopia av masteruppsatsen, 5) Namn och kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (e-post och telefonnummer), 6) Eventuella publikationer. Ansökan ska vara skriven på engelska.

Välkommen med din ansökan senast 8 maj 2026. UFV-PA 2026/844. 

Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.

Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet: https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/

Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.

Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.

Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.

Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se

Observera att detta är en förkortad version av annonsen. För att ta del av den fullständiga annonsen, klicka på ”Ansök här” eller besök Uppsala universitets webbplats: https://uu.se/jobb/